Mưa lớn, gió mạnh hay nắng hạn kéo dài đều có thể làm mất đàn trong một đêm. Cách phòng trước và xử lý sau ở điều kiện Đông Nam Bộ.
Nuôi ong dú không hoá chất: kiểm soát kiến và thiên địch bằng biện pháp cơ học, giữ vệ sinh thùng, chọn vùng không phun thuốc.